水母型的体壁结构与水螅型基本相似，也是由两层上皮肌肉细胞中间夹有中胶层构成，但水母型的中胶层远较水螅型发达。体壁围绕的胃循环腔也较发达，它或是一个简单的囊，或是被膜分隔成4个胃囊，由胃囊向伞缘伸出4条（水螅纲水母）或更多的（钵水母）辐射管，并与伞缘平行的环管相连，由环管也可伸出离心的小管进入触手，直达触手末端。在伞缘或触手基部有感觉器官，例如眼点或平衡囊。

不同的水母有不同的形态，水母身体的主要成分是水，其体内含水量一般可达98%以上，并由内外两胚层所组成，两层间有一个很厚的中胶层，不但透明，而且有漂浮作用。其他则是蛋白质和脂质所构成，所以水母的身体呈现透明状。它们没有心脏、血液、鳃和骨骼。普通水母的伞状体不很大，只有20-30厘米长。它们在运动之时，利用体内喷水反射前进，就好像一顶圆伞在水中迅速漂游。

水母的伞状体内有一种特别的腺，可以发出一氧化碳，使伞状体膨胀。水母触手中间的细柄上有一个小球，里面有一粒小小的听石，这是水母的“耳朵”。由海浪和空气磨擦而产生的次声波冲击听石，刺激着周围的神经感受器，使水母在风暴来临之前的十几个小时就能够得到信息，从海面一下子全部消失了。

有些水母不单颜色多变，而且还会在水中发光，有些闪耀着微弱的淡绿色或蓝紫色光芒，有的还带有彩虹般的光晕，当它们在海中游动时，就变成了一个光彩夺目的彩球。水母发光靠的是一种叫埃奎明的奇妙的蛋白质，这种蛋白质和钙离子混合时，就会发出强蓝光。埃奎明的量在水母体内越多，发的光就越强，每只水母平均只含有50微克。