针对这类富营养化问题突出的水体处理工艺，主要采用生态控制为主，人工控制为辅的方法来控制。首先通过不对称纤维过滤设备、光催化除藻设备和湖泊推流系统，除去湖泊水体中浮游藻类，同时在系统运行过程中，抑制湖泊浮游藻类的生长，必须保证浅水区清澈见底，其中浅水区要做到清澈见底，创造水生植被恢复的条件，在此基础上，恢复湖泊的沉水植被和挺水植被，沿湖泊浅水区种植沉水植物和挺水植物，不仅具有美化人工湖的功效，还能增加了人工湖的生物多样性，建立复杂而稳定的生物链，又减少了水体中存在的各种污染物，从生态上防止水体发生富营养化现象，同时沉水植物分泌化学物质来抑制藻类的大量繁殖，如金鱼藻、狐尾藻、苦草等就属于这类沉水植物。在湖心及周边设置4--10个生物浮岛，增加湖泊的景观效果，消减湖泊水体中N、P等营养盐，通过水生植物的化感作用，抑制水体中藻类生长，恢复湖泊洁净好氧生态系统，保持湖泊清澈、碧绿的景观效果。
优势
无需额外占用土地资源，占用河道面积小（每台仅占4.8m2），比人工湿地法可节省土地基建费用，缓解城市用地紧张；
无需人工操作、护理，系统可长期保持稳定运行，节省维护管理费用；
不使用，避免化学修复形成的“二次污染”；
见效快，充分提高水体溶氧量，增强水体自净作用，短期内（30d～50d）即可改善水体透明度；
美化河道景观，充分发挥水生植物去除重金属、氮磷营养盐能力，重建河道完整生物链，维持河道水体生态平衡；
具有高性价比的优势。河道修复成本在300万～350万元/km，修复治理完成后河道基本清澈见底，河水可以游泳。
用生物方法来处理景观水体
用生物方法来处理景观水是科学的,但也是复杂的。简单的说，就是模拟生态系统的结构，对食物链中的生物进行合理配置，从而使食物链中各个生物之间能相辅相成, 使整个生态系统越来越稳定,终达到净化水质的目的。一个完整的生态系统必须要有稳定的生产者、消费者、分解者。用生物方法来处理景观水体，就是模拟自然界中生产者、消费者、分解者的比例。水生植物就是景观水体当中的生产者，水生动物就是景观水体当中的消费者，微生物就是分解者。在实际运用当中，会结合项目本身需求，辅助搭配一些物理技术，以求更好的进行景观水处理。用生物方法来处理景观水会涉及到很多学科,像水生生物学、微生物学、水域生态学、水产养殖学等等重点学科，如何科学得将各学科运用到景观水处理当中，已成为景观水处理设计规划师的参照标准。
运用生物方法来处理景观水的优点是：适用范围广，大小面积水体都可以运用，系统稳定，无需更换，耗电量低，长期保持清澈，真正实现可持续发展，符合十八大建设生态家园的精神；缺点是工程复杂，技术性强，难度较高，需要专业队伍来打造。
设计原则：
一．统一协调
景观水处理的统一协调指的是在景观水处理营造时需要考虑与所在环境空间的景观特质相适应，相互依托。作为城市景观水处理并不是独立存在的，它与周边环境息息相关的。在景观水处理设计时，要注意统一性表现水处理应用形式、观赏特性、色彩表现形式等等。
二．目的明确
景观水处理有许多应用形式，不同的主题体现不同的特色。所以在处理时，要明确景观水处理的目的，即应该考虑一下景观水处理的意义是什么？地点是公共场所还是私人产所，是否要考虑儿童等等。
三．位置恰当
并不是所有的地方都是适合景观水处理的。在设计规划的时候，要充分考虑地形、气候特点、环境条件等等因素，否则会给景观水处理带来难以克服的阻碍。
四．可靠
景观水处理中的水道的防渗漏，水池的深浅设计等等都要杜绝各种潜在的不隐患，尤其要注意对儿童的保护。
五．风格独特
景观水处理设计时要强调地方性，要注意地方的文化和技术交流，不要照搬照抄其他地方的水处理设计，不能忽略了本地的环境特点与民族文化的内涵。
六．量力而行
景观水处理展现的形式丰富多彩，随着科技的发展，各种声音光线等元素融入到景观水处理当中。在设计不能一味求新，还要考虑后期的维护和运行费用等等。所以在进行景观水处理前要通过全盘仔细的分析，考虑各方面因素及财政后，在选择有实力的公司进行。
七．其他多方面考虑
其他应综合考虑的因素：景观水处理后会对当地环境方面产生什么影响，景观水处理中涉及到水景景观是观赏性的还是互动的，景观水处理过程中水源的补充等等。