在北京海淀区注册科技公司的工商税务流程主要包括以下几个步骤：

1. 准备注册资料：首先需要准备公司的名称、经营范围、注册资本、股东信息、法定代表人信息、公司地址等基础信息。法人和股东的身份证明文件，公司章程等也需提前准备好。

2. 网上申请：通过海淀区集群注册平台提交申请，提交相关材料进行在线审核。如果是特殊项目，可以在资料提交后立即进行当场审核。审核通过后，可以在海淀园创业中心或中关村创业大街网站直接打印出营业执照 。

3. 刻章：在公司注册完成后，需要到指定的地点刻制公司印章，包括公章、财务章和法人章。

4. 银行开户：选择银行进行账户开设，可以在线预约或线下预约。银行会到公司地址查验“公司章程”、“营业执照正副本原件”、“营业执照正本A4复印件”、“公章”、“财务章”、“法人章”、“住所证明”、“法人身份证”等材料。

5. 税务登记：开户后，需要登录国家税务总局北京市电子税务局平台，进行税务登记，包括网签三方协议等步骤。若未按时办理税务登记或提供虚假证明资料，将面临相应的法律责任和罚款 。

6. 税务合规：公司注册后，需确保税务合规，按时申报纳税，避免因违法行为受到处罚 。

整个注册流程需要密切关注政策变化及时办理相关手续，确保公司合法合规运营。每个步骤都不可忽视，以免影响公司的正常运营。